Центр является ведущим учреждением в Северо-Западном регионе России по внедрению в клиническую практику новейших медицинских технологий лечения заболеваний щитовидной железы, паращитовидных желез, надпочечников, поджелудочной железы. В секторе эндокринологии лечение осуществляется совместно терапевтами-эндокринологами и хирургами-эндокринологами.

       В Центре проводится оперативное лечение при заболеваниях эндокринной системы:

диффузный токсический зоб,
токсическая аденома щитовидной железы,
опухоли паращитовидных желез,
образования надпочечников любого происхождения (гормонально неактивные, феохромоцитома, альдостерома, синдром Иценко-Кушинга),
гормонпродуцирующие опухоли поджелудочной железы (инсулинома, гастринома).

      Операционные Центра соответствуют лучшим мировым стандартам по уровню экологичности и антибактериальной защиты, оснащены самым современным медицинским оборудованием ведущих мировых производителей. В Центре проводятся лапароскопические и видеоассистированные операции, малоинвазивные вмешательства на органах эндокринной системы, что значительно уменьшает операционную травму и обеспечивает хороший косметический эффект.

    Федеральный центр сердца, крови и эндокринологии имени В.А. Алмазова является единственным лечебным  учреждением в Северо-Западном регионе России, где используется роботизированный хирургический комплекс «Да Винчи» (da Vinci Robot). Комплекс состоит из трех главных частей: операционная консоль с четырьмя рабочими манипуляторами, приборная доска и панель управления для работы оперирующего хирурга, откуда он управляет всеми манипуляциями робота. В режиме реального времени робот копирует каждое движение оператора, сидящего за панелью управления. Механические «руки» робота воспроизводят движения кистей и пальцев хирурга, снижается усталость врача, повышается качество операции.