Научно-исследовательская группа биобанкирования

Мельник Олеся Владимировна
Руководитель НИГ биобанкирования, к.м.н.

История создания группы

Научно-исследовательская группа биобанкирования (НИГ биобанкирования) была образована в Центре Алмазова в 2012 году. Представляет собой научно-исследовательский Биобанк и является неотъемлемой частью научно-исследовательской жизни учреждения, необходимым условием развития персонализированной и трансляционной медицины.

Работа по развитию персонифицированной и трансляционной медицины — одно из приоритетных направлений деятельности Центра Алмазова и стратегия развития российской науки в целом. Развитие трансляционной медицины позволяет проводить оперативный перенос результатов фундаментальных исследований (главным образом в области клеточной и молекулярной биологии, генетики и биохимии) в клиническую практику, что делает данное направление особенно перспективным и востребованным.

В своей деятельности НИГ биобанкирования придерживается международных рекомендаций ISBER (International Society for Biological and Environmental Repositories), руководствуется Конституцией Российской Федерации, федеральными законами, приказами Министерства здравоохранения Российской Федерации, а также Этическим комитетом и Уставом Центра Алмазова.

Биоресурсные коллекции НИГ биобанкирования включают в себя более 50 000 биообразцов и охватывают широкий спектр патологии как взрослой, так и детской когорт пациентов.

Благодаря мощной клинической базе Центра Алмазова Биобанк располагает коллекциями биообразцов от пациентов с сердечно-сосудистой, гематологической, эндокринологической, акушерско-гинекологической патологией, врожденными изолированными и сочетанными пороками развития, биообразцами от пациентов, страдающих нейромышечными заболеваниями с вовлечением в патологический процесс сердечной мышцы, от пациентов с редкими генетическими синдромами, включая материал родственников первой линии родства в случае возможности его забора. Помимо описанных коллекций, Биобанк НМИЦ им. В. А. Алмазова располагает коллекцией биообразцов эпидемиологического проекта ЭССЕ, а также уникальными образцами, полученными от жителей Ленинграда, переживших блокаду.

Задачи группы

• Пробоподготовка, аликвотирование, ответственное хранение образцов различного биологического материала при требуемых температурных условиях, а также ассоциированной с ними клинико-демографической информации.
• Создание коллекций биологических образцов, полученных от пациентов с различной патологией, включая материал родственников первой линии родства в случае возможности его забора.
• Проведение работ по культивированию первичных клеточных линий, выделению мононуклеаров костного мозга, периферической крови, получению buffycoat, а также по генотипированию ДНК.
• Хранение биоресурсных коллекций биологического материала человека (цельной крови и ее производных, ДНК, мононуклеаров костного мозга и периферической крови, лейкоцитарных пленок, тканей, первичных клеточных линий), созданных в рамках реализуемых в ФГБУ «НМИЦ им. В. А. Алмазова» Минздрава России научно-исследовательских работ.

Участие в государственных заданиях

С 2020 года по 2022 сотрудники НИГ выполняют тему государственного задания: «Разработка методов диагностики и терапии новой нозокомиальной инфекции, обусловленной Candida auris».

При выполнении второго этапа исследований по выполнению государственного задания «Разработка методов диагностики и терапии новой нозокомиальной инфекции, обусловленной С.аuris» проведено исследование особенностей инфекций кровотока, выявленных в Российской Федерации, антимикробной резистентности выделенных возбудителей, филогенетических характеристик штаммов, изолированных их крови, разработали собственную методику выявления мутаций в гене ERG11.

Разработана тест-система по определению мутаций в гене ERG11, ассоциированного с резистентностью к азолам. Выявлена замена K143R во всех исследованных штаммах, характерную для С. аuris южноазиатского происхождения с резистентностью к флуконазолу.

НИГ биобанкирования ФГБУ «НМИЦ им. В. А. Алмазова» Минздрава России является членом Национальной ассоциации биобанков и специалистов по биобанкированию (НАСБио) и открыт для сотрудничества. Весь объем биологического материала НИГ биобанкирования доступен как для экспериментальной работы в рамках научно-исследовательских проектов Центра Алмазова, так и для предоставления в научно-исследовательские организации, такие как медико-биологические НИИ, фармакологические и биотехнологические компании, что является необходимым условием для развития трансляционной медицины.

Международное сотрудничество

Выполнение научно-исследовательской работы по научному протоколу «Углубленное обследование пациентов с семейной гиперхолестеринемией с выполнением генетического исследования, оценкой традиционных и новых маркеров субклинического атеросклероза» в рамках сотрудничества с Миланским университетом.

В 2020 году на базе НИГ биобанкирования был организован Центр коллективного пользования Биобанк.