| В структуре учреждения в 2025 году работают 613 научных сотрудника: основные — 224 сотрудника, в том числе с учеными степенями – 113 человек (50,4%). Исследования проводили 133 ученых, из которых больше половины молодых ученых младше 39 лет (67 сотрудников (50,4%)).
Под руководством академика РАН, профессора, д.м.н. Е.В. Шляхто успешно работают ведущие ученые страны, включая академика РАН, трех член — корреспондентов РАН, трех профессоров РАН, доктора (158) и кандидаты наук (494) по различным специальностям.
- Институт сердца и сосудов (33 подразделения)
- Институт метаболического синдрома (6 подразделений)
- Институт молекулярной биологии и генетики (10 подразделений)
- Институт экспериментальной медицины (13 подразделений)
- Институт эндокринологии (5 подразделений)
- Институт перинатологии и педиатрии (7 подразделений)
- Институт онкологии и гематологии (5 подразделения)
- Российский научно-исследовательский нейрохирургический институт им. проф. А. Л. Поленова — филиал Центра Алмазова (14 подразделений)
- Комплекс «Центр доклинических и трансляционных исследований» (11 подразделений)
- Научно-исследовательский центр развития искусственного интеллекта в медицине (2 подразделения)
- Отдел клинических исследований
- Центры коллективного пользования (ЦКП): комплекс «Центр доклинических и трансляционных исследований»; ЦКП Биобанк ФГБУ «НМИЦ им. В. А. Алмазова» Минздрава России.

Научная составляющая Центра Алмазова
— Научный центр мирового уровня «Центр персонализированной медицины»
— Институт сердца и сосудов (33 подразделения)
— Институт молекулярной биологии и генетики (9 подразделений)
— Институт экспериментальной медицины (15 подразделений)
— Институт эндокринологии (5 подразделений)
— Институт перинатологии и педиатрии (11 подразделений)
— Институт онкологии и гематологии (4 подразделения)
— Российский научно-исследовательский нейрохирургический институт им. проф. А.Л. Поленова — филиал Центра Алмазова (12 подразделений)
— Научно-исследовательский отдел лучевой диагностики (3 подразделения)
— Научно-исследовательский отдел микробиологии и внутрибольничных инфекций
— Научно-исследовательская лаборатория патоморфологии
— Научно-исследовательская лаборатория ревматологии и иммунопатологии
— Комплекс «Центр доклинических и трансляционных исследований»
— Биобанк
— Научно-исследовательский центр развития искусственного интеллекта в медицине
— Научно-исследовательский отдел клинических исследований и доказательной медицины
— Центры коллективного пользования (ЦКП): комплекс «Центр доклинических и трансляционных исследований»; ЦКП Биобанк ФГБУ «НМИЦ им. В.А. Алмазова». |