Гранты РНФ

1. Структурно-молекулярные механизмы дисфункции ионных каналов Nav1.5, Cav1.2 и TRPM4 в миокарде.
№ соглашения о гранте: 22-15-00186.
Название фонда, предоставляющего грант: РНФ, Конкурс на получение грантов РНФ по мероприятию «Проведение фундаментальных научных исследований и поисковых научных исследований отдельными научными группами».
Руководитель гранта: Жоров Б. С., научный сотрудник группы клеточной биологии Института молекулярной биологии и генетики.

Основные результаты:
• Обнаружена мутация R964S в канале TRPM4 у пациента в центре им. Алмазова. Показано, что в 3D структуре этого канала R964 образует солевой мостик с D984. Мутация R984S дестабилизирует селективный фильтр, что может объяснить дисфункцию канала.
• Показано, что эмпаглифлозин (ингибитор котранспортера натрия-глюкозы) модулирует ионные каналы в сердце рыбки данио-рерио. Этот механизм может быть перспективен для защиты сердца.
• С помощью искусственного интеллекта (AlphaFold2) построены 3D модели натриевого канала насекомых и осуществлен докинг инсектицидов. Полученные данные важны для дизайна новых лигандов натриевых каналов.
• С помощью искусственного интеллекта (AlphaFold2) построены 3D модели сплайс-вариантов кальциевых каналов Т-типа Cav3 двух модельных организмов. Объяснены парадоксальные различия ионной селективности сплайс вариантов. Предложены мутации переключающие ионную селективность каналов. Последующие эксперименты полностью подтвердили предсказания моделей.

Репрезентативное изображение изолированного кардиомиоцита желудочка рыбки данио, используемого для экспериментов с патч-клэмпом. Увеличение: 40×. (B) Репрезентативное изображение окрашивания актиновых нитей (зеленый) с использованием фаллоидина в кардиомиоцитах рыбок данио. Ядро (синее) визуализировали с помощью DAPI. Шкала бара составляет 20 мкм. © Сгруппированные данные теста МТТ для кардиомиоцитов, обработанных эмпаглифлозином. Данные выражены в % от значения, полученного для необработанных клеток.

2. Влияние эндоваскулярной изоляции аневризмы аорты различной локализации на параметры центральной гемодинамики и структурно-функциональное состояние сердца.
№ соглашения о гранте: 23-25-00272
Название фонда, предоставляющего грант: РНФ, Конкурс 2022 года «Проведение фундаментальных научных исследований и поисковых научных исследований малыми отдельными научными группами»
Руководитель гранта: Конради А.О., заместитель генерального директора по научной работе.

Основные результаты:
Была разработана сетка (форма, структура и объем) и ключевые переменные для базы данных пациентов НМИЦ им. В.А. Алмазова, которым была выполнена эндоваскулярная изоляция торакоабдоминальной аневризмы аорты. Данная база данных была зарегистрирована (Реестр пациентов с аневризмой нисходящего или брюшного отделов аорты и артериальной гипертензией, прошедших процедуру эндоваскулярной изоляции. Аневризмы «(T) EVAR in Hypertensives. Almazov NMRC»; свидетельства о государственной регистрации № 2023620874 от 13.04.2023).

3. Разработка инновационной диагностически-прогностической модели прогрессирования нейродегенеративного процесса и оценки резервов нейропластичности при рассеянном склерозе с целью раннего применения персонифицированного терапевтического подхода.
№ соглашения о гранте: 23-25-00419
Название фонда, предоставляющего грант: РНФ, Конкурс 2022 года «Проведение фундаментальных научных исследований и поисковых научных исследований малыми отдельными научными группами»
Руководитель гранта: Бисага Г.Н., профессор кафедры неврологии и психиатрии с клиникой Лечебного факультета Института медицинского образования.

Основные результаты: 
На текущий момент набрано 50 пациентов с рассеянным склерозом для основной группы пациентов. У 50 человек выполнено клиническое тестирование, оптическая когерентная томография сетчатки, анализ легких цепей нейрофиламентов, данные находятся в обработке. 42 пациентам выполнена МР-морфометрия. При признаках прогрессирования РС по данным клинического тестирования, наблюдается снижение объемов подкорковых структур на МРТ.

4. Разработка стратегии повышения безопасности применения варфарина при беременности путем ограничения его трансплацентарного переноса.
№ соглашения о гранте: 23-25-00515
Название фонда, предоставляющего грант: РНФ, Конкурс 2022 года «Проведение фундаментальных научных исследований и поисковых научных исследований малыми отдельными научными группами»
Руководитель гранта: Загородникова К.А., доцент Кафедры инфекционных болезней Лечебного факультета Института медицинского образования

Основные результаты: 
Разработаны схемы синтеза PLGA различного размера для проведения дальнейшего эксперимента in vivo с выбором необходимого размера частиц для поставленной цели. Охарактеризованы физико-химические свойства полученных наноразмерных носителей, включая морфологию, химический состав, удельную поверхность, распределение по размерам, электрокинетический потенциал.

5. Молекулярные механизмы пробиотик-индуцированной кардиопротекции при системном воспалении.
№ соглашения о гранте: 23-15-00139
Название фонда, предоставляющего грант: РНФ, Конкурс 2023 года «Проведение фундаментальных научных исследований и поисковых научных исследований отдельными научными группами»
Руководитель гранта: Галагудза М.М., директор Института экспериментальной медицины

Основные результаты:
Проведено пилотное исследование, подтверждающее гипотезу об общих и специфических особенностях влияния живой и инактивированной культуры при моделировании синдрома системного воспалительного ответа на мелких грызунах.

6. Применение многофункциональных наночастиц для тераностики инфаркта миокарда: флуоресцентная визуализация и мультитаргетное терапевтическое воздействие.
№ соглашения о гранте: 23-15-00151
Название фонда, предоставляющего грант: РНФ, Конкурс 2023 года «Проведение фундаментальных научных исследований и поисковых научных исследований отдельными научными группами»
Руководитель гранта: Сонин Д.Л., Заведующий Научно-исследовательским отделом микроциркуляции и метаболизма миокарда Центра экспериментального биомоделирования Института экспериментальной медицины

Основные результаты:
Разработан метод синтеза липосом размером 150-200 мн. Проведена инкапсуляция флуоресцентных красителей индоцианина зеленого, флуоресцеин изотиоцианата.и действующего вещества квинакрина внутрь липосом. Исследована кинетика высвобождения квинакрина из наноразмерных липосом. Получены наночастицы альбумина и в настоящее время ведутся работы над опимизацией условий их синтеза.

7. Изучение вазореактивного резерва сосудов малого круга кровообращения с целью разработки алгоритма рациональной терапии легочной артериальной гипертензии.
№ соглашения о гранте: 23-15-00318
Название фонда, предоставляющего грант: РНФ, Конкурс 2023 года «Проведение фундаментальных научных исследований и поисковых научных исследований отдельными научными группами»
Руководитель гранта: Моисеева О.М., главный научный сотрудник Научно-исследовательского отдела некоронарогенных заболеваний сердца Института сердца и сосудов

Основные результаты:
Проведен анализ выживаемости пациентов с идиопатической легочной гипертензией в зависимости от возраста, сопутствующих заболеваний и объема специфической терапии. Завершен предварительный анализ базы данных магнитно-резонансной томографии сердца для оценки диагностического и прогностического значения выполнения данного исследования у пациентов с легочной артериальной гипертензией.

8. Изучение роли обмена железа в патогенезе, прогрессировании и прогнозе редких вариантов легочной гипертензии.
№ соглашения о гранте: 23-75-01057
Название фонда, предоставляющего грант: РНФ, Конкурс 2023 года «Проведение инициативных исследований молодыми учеными» Президентской программы исследовательских проектов, реализуемых ведущими учеными, в том числе молодыми учеными
Руководитель гранта: Жиленкова Ю.И., Доцент кафедры лабораторной медицины с клиникой Лечебного факультета Института медицинского образования

Основные результаты:
В исследование на данный момент включено 10 пациентов с легочной артериальной гипертензией (ЛАГ) (2 мужчин, 18 женщин, возраст 44,0 [32; 60] лет) и 30 пациентов с ХТЭЛГ (14 мужчин, 16 женщин, возраст 55,5 [42; 67] лет) с верифицированной прекапиллярной легочной гипертензией (среднее давление в легочной артерии > 20 мм рт.ст., давление заклинивания легочной артерии < 15 мм рт.ст. и легочное сосудистое сопротивление > 2 ед.Вуда). Диагноз ЛАГ и ХТЭЛГ были верифицированы в соответствии с клиническими рекомендациями. Всем пациентам проводится общеклиническое обследование, спирография с бронходилатационным тестом (VIASYS Healthcare Hoechberg, Германия), эхокардиографическое исследование (VIVID 7D, GE, США), КТ-ангиопульмонография, кардиопульмональное нагрузочное тестирование Oxycon Pro (CARDINAL HEALTH, Германия) и катетеризация правых камер сердца.

9. Механизмы фиброзного ремоделирования сосудов малого круга кровообращения при различных формах легочной гипертензии и поиск новых терапевтических воздействий.
№ соглашения о гранте: 23-75-10122
Название фонда, предоставляющего грант: РНФ, Конкурс 2023 года «Проведение исследований научными группами под руководством молодых ученых» Президентской программы исследовательских проектов, реализуемых ведущими учеными, в том числе молодыми учеными
Руководитель гранта: Карпов А.А., заведующий НИЛ Патологии малого круга кровообращения Центра доклинических трансляционных исследований Института экспериментальной медицины

Основные результаты:
Выполнен анализ транскриптома из ткани легких крыс с различными формами легочной гипертензии. С этой целью было выполнено моделирование хронической тромбоэмболической легочной гипертензии (ХТЭЛГ) путем многократного внутривенного введение частично биодеградируемых микросфер из альгината натрия, а также моделирование легочной артериальной гипертензии с помощью подкожного введения монокроталина (Sigma-Aldrich, США) 60 мг/кг однократно.

Анализ транскриптома проводился на образцах, выделенных из цельной ткани легкого крыс. Изучались следующие группы образцов: ХТЭЛГ через 2 недели после моделирования (n = 4), ХТЭЛГ 6 недель после моделирования (n = 4), ЛАГ 6 недель (n = 4). В качестве контроля были использованы здоровые крысы (n = 6).

В результате исследования были выявлены дифференциально экспрессирующиеся гены (DEG) для каждого патологического состояния по сравнению с контролем. Анализ DEG показал, что в группе ХТЭЛГ 6 недель большая часть DEG имеют пониженную экспрессию, в то время как в группе ХТЭЛГ 2 недели число DEG, имеющих пониженную и повышенную экспрессию, сопоставимо. Это свидетельствует о том, что к 6 неделям завершаются процессы ремоделирования.

10. Молекулярые основы участия субпопуляций внеклеточных везикул в развитии системного воспалительного ответа, инициированного повреждением элементов сердечно-сосудистой системы.
№ соглашения о гранте: 19-75-20076-П.
Название фонда, предоставляющего грант: РНФ, Конкурс на продление сроков выполнения проектов, поддержанных грантами Российского научного фонда по мероприятию «Проведение исследований на базе существующей научной инфраструктуры мирового уровня» Президентской программы исследовательских проектов, реализуемых ведущими учеными, в том числе молодыми учеными.
Руководитель гранта: Головкин А. С., ведущий научный сотрудник-руководитель группы генно-клеточной инженерии Института молекулярной биологии и генетики.

Основные результаты:
В результате проведенных экспериментальных исследований по моделированию ишемического и реперфузионного повреждения миокарда у крыс было установлено, что хирургический доступ сам по себе вызывает повышение ядерной ДНК в плазме крови. С целью поиска микроРНК, способных маркировать повреждения кардиомиоцитов, в динамике были исследованы уровни микроРНК-1, микроРНК-133, микроРНК-208а и микроРНК-499. Было показано, что уровни всех исследуемых микроРНК коррелируют с уровнями кардиоспецифичной изоформы тропонина: микроРНК-133a (r=0,88, p<0,01), микроРНК-208а (r=0,88, p<0,01), микроРНК-499 (r=0,92, p<0,01). При этом торакотомия вносит основной вклад в повышение микроРНК-1 и микроРНК-133а, а микроРНК-208а повышается только в группах с повреждением миокарда. Уровни микроРНК-499 позволяют отличить друг от друга все экспериментальные группы, моделирующие последовательные повреждения, которые получает пациент в ходе АКШ.

Была разработана и апробирована методика сортировки внеклеточных везикул с помощью метода проточной цитометрии высокого разрешения и флуоресцентно меченых антител.

Был разработан и отработан протокол фракционирования эритроцитов, тромбоцитов, лейкоцитов и внеклеточных везикул, который включал этапы дифференциального центрифугирования и иммунофлуоресцентного сортинга. На основании анализа двух стандартизованных протоколов выделения РНК, реагента Trizol и набора SPLIT RNA Extraction Kit (Lexogen), с целью получения максимального выхода пула малых некодирующих РНК из исследуемых образцов фракций был выбран и адаптирован протокол набора SPLIT RNA Extraction Kit (Lexogen). Для приготовления библиотек был выбран и апробирован набор Small RNA-Seq Kit (Lexogen).

11. Роль цитоскелетных и Z-диск ассоциированных белков в патогенезе заболеваний миокарда и скелетной мускулатуры.
№ соглашения о гранте: 20-15-00271-П.
Название фонда, предоставляющего грант: РНФ, Конкурс на продление сроков выполнения проектов, поддержанных грантами Российского научного фонда по приоритетному направлению деятельности Российского научного фонда «Проведение фундаментальных научных исследований и поисковых научных исследований отдельными научными группами»
Руководитель гранта: Костарева А. А., директор Института молекулярной биологии и генетики.

Основные результаты:
В ходе выполнения проекта было проведено генетическое исследование (таргетное секвенирование, полноэкзомное секвенирование) пациентов с различными формами кардиомиопатий, были обнаружены редкие и впервые описанные генетические варианты, ассоциированные с заболеванием.

Отработаны условия формирования внутриклеточных агрегатов десмина при одновременном подавлении экспрессии гена Bag3 и ведении мутантных форм десмина. Получены данные об изменении транскриптомного профиля на фоне формирования внутриклеточных десминовых агрегатов.

Было проведено исследование экспрессионного статуса клеток методом РНК-секвенирования после введения в мышечные клетки различных мутаций гена десмина и после подавления экспрессии гена Bag3. Было отмечено нарастание степени формирования внутрикелточных агрегатов и появление признаков внутриклеточного воспаления на фоне формирующихся агрегатов.

В рамках проекта сформирован значительный научный и технологический задел для последующей разработки геннотерапевтических препаратов в области редких наследственных заболеваний в кардиологии.

12. Развитие методов микрофлюидики для микрореакторного синтеза тераностических агентов на основе магнитных липосом.
№ соглашения о гранте: 24-25-00056
Название фонда, предоставляющего грант: РНФ, Конкурс 2023 года «Проведение фундаментальных научных исследований и поисковых научных исследований малыми отдельными научными группами»
Руководитель гранта: Королев Д. В., заведующий научно-исследовательской лабораторией нанотехнологий Института экспериментальной медицины.

13. Роль циркадианных факторов в регуляции нейропластичности при ишемическом инсульте.
№ соглашения о гранте: 21-75-10173.
Название фонда, предоставляющего грант: РНФ, Конкурс 2021 года «Проведение исследований научными группами под руководством молодых ученых» Президентской программы исследовательских проектов, реализуемых ведущими учеными, в том числе молодыми учеными
Руководитель гранта: Коростовцева Л. С.

Основные результаты:
• установлена взаимосвязь генетических факторов с исходами инсульта (неврологический дефицит при поступлении и при выписке пациентов, разница в неврологическом дефиците на момент поступления и к моменту выписки), с характеристиками инсульта (подтип инсульта по классификации TOAST и данными нейровизуализирующих методов исследования) и с характеристиками сна.
• установлена взаимосвязь показателей сна с исходами инсульта (разница в неврологическом дефиците на момент поступления и через 14 дней) и с характеристиками инсульта (подтип и данные нейровизуализирующих методов исследования).
Установлено, что генотип PER3 4/4 чаще ассоциирован с развитием ишемического инсульта неустановленной этиологии (61.9%), генотип PER3 4/5 — с инсультом кардиоэмболического типа (32.7%) и инсультом неустановленной этиологии (32.7%), а генотип PER3 5/5 – с кардиоэмболическим инсультом (41.7%) (p=0.007).

Проанализирован вклад сопутствующих заболеваний в формирование когнитивного дефицита (использован интегральный когнитивный фактор) у пациентов после перенесенного острого нарушения мозгового кровообращения (ОНМК). Согласно полученным данным, атеросклероз сосудов головного мозга, и ишемическая болезнь сердца являются предикторами неблагоприятного прогноза по формированию когнитивных нарушений после перенесенного ОНМК.

Еще одним предиктором неблагоприятного прогноза было ночное время развития ОНМК (p<0,001). Можно предположить, что в данном случае худший прогноз по развитию и динамике когнитивных нарушений связан с более продолжительным временем до госпитализации и начала лечебных мероприятий, однако нельзя исключить и влияние циркадианных факторов, что планируется оценить при дальнейшей работе.